台当局与日本10日签署渔业协议，日本允许台湾渔船进入钓鱼岛附近海域捕捞，马英九11日称，这代表台湾与日本的关系进入一个新阶段。该协议也受到大陆关切，未来大陆渔船是否可进入协议的范围海域捕鱼，11日成为两岸关注的焦点。
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据台湾《联合晚报》11日报道，马英九当天接见“日本交流协会”会长大桥光夫时说，他感谢日本在渔业协议议题展现诚意与善意，也期待台日特别伙伴关系能持续进展。马英九当天还在社交网络上称，台日签成渔业协议，这证明台湾对日政策方向正确，他称在钓鱼岛主权上没有任何让步，代表台湾与日本的关系进入一个新阶段。
据台湾《旺报》11日报道，在10日的台日渔业协议记者会上，台湾“海巡署”署长王进旺被问到，如果大陆海监船或渔船进入台日协议的适用海域，台湾会有何作为？王进旺回应称：“依规定，予以驱离并劝导离开。”“渔业署”副署长蔡日耀11日在“立法院”答询时也表示，台日渔业协议只适用于台湾和日本的渔船，大陆渔船不适用。蔡日耀称，两岸之间目前没有设渔业委员会，台日之间才有台日渔业委员会，可协议双方如何应对相关实务案例处理。
不过，岛内保钓团体对该协议并不满意，台湾“中华保钓协会”理事长谢梦麟11日表示，台日签署渔业协议，形同日本拥有实质管辖权，保钓未来还是要登岛。
中国社科院台湾研究所研究员王建民11日接受记者采访时称，台日渔业谈判之前谈了16次都没谈成，为何唯独这次谈成了，很明显有日本的政治考量，日本就是想离间两岸合力保钓，这次渔业协定背后不排除台日之间存在政治交易。台当局随后对大陆渔船的态度，恰恰表明了这种迹象。台湾表面上取得一些利益，但损害了中华民族的整体利益，破坏了两岸互信，最终不利于台湾的发展，台当局应该感到羞耻，而不是沾沾自喜。
